Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms