Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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