Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Efnb1P52795 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms