Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PkmP52480 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PkmP52480 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PkmP52480 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PkmP52480 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PkmP52480 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PkmP52480 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PkmP52480 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PkmP52480 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms