Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms