Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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SftpbP50405 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SftpbP50405 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SftpbP50405 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SftpbP50405 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpbP50405 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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