Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SftpdP50404 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms