Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brca1P48754 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brca1P48754 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms