Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GdnfP48540 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms