Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx2P48379 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms