Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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