Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Resp18P47939 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Resp18P47939 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Resp18P47939 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms