Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms