Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms