Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms