Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms