Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpargP37238 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpargP37238 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpargP37238 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PpargP37238 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpargP37238 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpargP37238 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PpargP37238 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PpargP37238 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpargP37238 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpargP37238 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms