Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc5P35689 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms