Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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