Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnd1P30999 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms