Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms