Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RxraP28700 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RxraP28700 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxraP28700 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxraP28700 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms