Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col2a1P28481 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col2a1P28481 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms