Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa3P28310 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa3P28310 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa3P28310 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms