Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms