Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb9P28076 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Psmb9P28076 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms