Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CebpbP28033 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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