Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
U2af2P26369 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
U2af2P26369 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms