Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna1P26231 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms