Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hoxd8P23463 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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