Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ggta1P23336 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms