Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms