Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms