Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmnb2P21619 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms