Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb4P21440 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms