Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gna11P21278 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gna11P21278 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms