Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P20040 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P20040 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P20040 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms