Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfaP20033 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PdgfaP20033 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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