Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcnaP17918 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcnaP17918 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms