Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa-rs1P17533 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms