Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou4f1P17208 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms