Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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