Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cd44P15379 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms