Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Irf1P15314 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Irf1P15314 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Irf1P15314 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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