Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt1P13864 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms