Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms