Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrm1P12657 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrm1P12657 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms