Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa1P11477 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms