Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms