Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P10404 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P10404 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P10404 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
P10404 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P10404 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P10404 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P10404 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P10404 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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